La Fundación Oswaldo Cruz es una institución localizada en la ciudad del Río de Janeiro, Brasil. ES conectada al gobierno federal brasileño, y tiene como objetivo promover investigaciones en el área de la salud pública.
Los orígenes de la fundación remontan al inicio del siglo XX con la creación del Instituto Soroterápico Federal en 25 de mayo de 1900 (cuyo objetivo inicial era lo de fabricar soros y vacunas contra la peste). En 1901, pasó para el gobierno federal, con el nombre modificado para Instituto Soroterápico Federal.
En 12 de diciembre de 1907 , pasó a denominarse Instituto de Patología Experimental de Manguinhos (referencia al nombre del barrio carioca donde queda su sede) y, en 19 de marzo de 1918 , en homenaje a Oswaldo Cruz, pasó a llamarse Instituto Oswaldo Cruz. En mayo de 1970, se hizo Fundación Instituto Oswaldo Cruz, adoptando la sigla Fiocruz, que continúa a ser utilizada aún tras mayo de 1974, cuando recibió la actual designación de Fundación Oswaldo Cruz.
Su principal objetivo es la investigación y el tratamiento de las enfermedades tropicales. Su trabajo no se limitó al Río de Janeiro ni a la investigación y producción de vacunas. En las campañas de saneamento de las ciudades asoladas por surtos y epidemias de fiebre amarilla, varíola y peste bubônica, tuvo que enfrentar una cerrada oposición y uno levante popular — la Revuelta de la Vacuna. Al ocuparse de condiciones de vida de las poblaciones del interior, dio origen a debates que resultaron en la creación del Departamento Nacional de Salud Pública, en 1920.
En 1970, el instituto y otros órganos federales fueron congregados en la Fundación Oswaldo Cruz, más conocida como Fiocruz, actualmente considerada una de las más importantes instituciones brasileñas de investigación en el área de la salud.
Además del desarrollo de nuevas tecnologías para la fabricación en ancha escala de las vacunas contra la fiebre amarilla y la varíola , deben ser citadas otras importantes contribuciones relativas al descubrimiento de la vacuna contra el carbúnculo del gado, o peste de la manqueira, por Alcides Godoy; los estudios de micologia de Olympio Oliveira Ribeiro de la Fonseca (1895-1978) y Arêa León; la descripción completa del fungo responsable por la paracoccidiomicose, más conocida por las malas de Lutz, por Adolfo Lutz (1855-1940); las investigaciones sistemáticas de helmintos, de Lauro Pereira Travassos (1890-1970); la descripción del ciclo del Schistosoma mansoni (ver Esquistossomose); la causa del tifo exantemático — el germe bacteriforme Rickettsia prowasecki — por Roca Lima; y el aislamiento del virus de la SIDA en circulación en el Brasil, por Bernardo Galvão.